Mapeamento cromossômico comparativo em espécies de Glycine Willd., Phaseolus L. e Vigna Savi

Abstract

Um estudo genômico comparativo foi realizado mediante localização in situ de oligonucleotídeos com padrão de microssatélites [(AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6] e dos domínios RT dos retrotransposons Ty1-copia-like e Ty3-gypsy-like, ao longo dos cromossomos de Glycine max, Phaseolus vulgaris, P. lunatus, Vigna unguiculata e V. radiata. Os oligonucleotídeos apresentaram-se em grande proporção nos genomas analisados, porém houve variação em quantidade, organização e distribuição ao longo dos cromossomos. Na análise genômica de soja, observou-se números e tamanhos (30 a 454 pb) de sítios de repetições variáveis localizados, principalmente, em regiões de alta a moderada densidade gênica, por vezes associados a genes e elementos transponíveis. A associação da FISH e análise in silico ressaltou uma distribuição diferencial não aleatória dos oligonucleotídeos, podendo estar preferencialmente associados à heterocromatina ou à eucromatina. Os domínios RT de Ty1-copia-like e Ty3-gypsy-like foram amplificados em V. unguiculata, sendo a sequência de Ty1-copia-like menos homogênea. As análises filogenéticas enfatizaram a origem monofilética dos referidos domínios RT. A FISH evidenciou a presença de sinais dispersos e pericentroméricos, utilizando ambos retroelementos, com algumas divergências interespecíficas. Em algumas espécies, tais marcações estavam associadas a DNAr 5S e 45S, bem como localizadas em regiões heterocromáticas, enfatizando uma distribuição preferencial nos genomas estudados. Os microssatélites e retrotransposons são apontados como importantes componentes dos genomas em espécies do clado Phaseoloids (tribo Phaseoleae), propiciando uma discussão sobre o potencial estrutural e funcional dessas sequências repetitivas